故事的舞台是互联网()系统发达的都市「()DEN CITY」。
在那里有经由巨型企()业「SOL技术社」通过高度的网络()技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空()间。人们都在那()个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世()界=电子界”毁灭。
然而在世界受到这样的威胁时,有一名决斗者站()了出来。而他的名字正是「Playmaker」。
在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压()倒性的()决斗将「海诺因骑士团」()打倒,成功捕获了()「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界,然后却突然()消声匿迹了,而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播,成为了传()说。
而现在,作为「Playmaker」的正体的某位()高中生藤木游作,为了寻找过去()发()生的某件事件的真相,对再次在()「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转动……()
迷之AI的真身,「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」()的目的,以及隐藏在游作()过去的真相到底是———
所有的答案,都在「Link Vrains」中