故事的舞()台是互联网系统发达的都()市「DEN CITY」。
在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新()的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团()「海诺因骑士团」。而他()们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电()子界”毁灭。
然()而在世界受到这样的威胁时,有一名决斗()者站了()出来。而他的名字正是「Playmaker」。
在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压倒性的决斗将()「海诺()因骑士团」打倒,成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界(),然后却突然消声匿迹()了,而他的名字就在互联网的世界中一()瞬间变得声名()远播,成为了传()说。
而现在,作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作,为()了寻找过去发生的某件事件的真相,对再()次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转()动……
迷之AI的真身,「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的,以及隐藏在游作过去的真相到底是———
所有的()答()案,都在「Link Vrains」中