故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。
() 在那里有经()由巨型企业()「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间()。人们都在那个VR空间中为体()验到全新的决斗而狂热()。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进()行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士()团」。而他们()的目标()是将存在于互联网的某处的“AI们()的世界=电子界”毁灭。
然而在世界受到这()样的威胁时,有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。
在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒,成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界,然后却突然消声匿迹()了,而他的名字就在互联网的世界中一()瞬间变得声名远播,成为了传()说。
而现在,作为「Playmaker」的正体的某位高()中生藤木游作,为了()寻找过去发生的某件事件的真相,对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转动……
() 迷之AI的真身(),「海诺因骑士团」盯上()「Link Vrains」的目的,以及隐藏在游作过去的真相到底是———
所有的答案,都()在「Link Vrains」中