故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。
() 在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的()网络技术构筑()而成的()被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决()斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之()黑客集团「海诺因骑士团()」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。
然而在世界受到这样的威胁时,有一名决斗者()站了()出来。而他的名字正是「Playmaker」。
在那场传奇的战斗中,「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒,成功()捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界,然后却突()然消声匿迹了,而他的名字就在()互联网()的世界中一瞬间()变得声名远播,成为了传说。
而现在,作为「Playmaker」的正体()的某位高中生藤木游作,为了()寻找过去发生的某件事件的真相,对()再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」()展开了追击...... 以此为契机,命运的齿轮就此转动……
迷之AI的真身,「()海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的,以及隐藏在游作过去的真相到底()是———
() 所有的答案,都在「Link Vrains」中